西曆5012年，突然向地球飛來的＜外星人＞與其＜機械生命體＞，讓人類身陷滅絕的危機。僅存的人類逃往月球，並為了重回地球開始＜人造人＞反攻作戰。但是，無限增殖的＜機械生命體＞使戰爭進入膠著，人類派出最終兵器新型人造人＜寄葉＞前往地球。抵達新地球的＜2B＞與＜9S＞共同執行任務，遭遇了數個不可思議的現象…這是一個為了人類而戰，＜人造人＞們的物語。