新科技迅速發展的近未來中，社群網站上出現了被稱為「全像幽靈」的怪奇現象。某天，中學生‧天河宙啟動了父親留下的「人體連動育成手環 暴龍機-V-」裝置後，便能看見未知生物─數碼獸。自從宙遇見伽馬獸的那天起，他便被捲進各種怪奇現象中。 偷走人類時間的「縫口男」、在暗夜中徘徊的「木乃伊男」…「全像幽靈」正對我們虎視眈眈。由此開始，展開了無人知曉的世界裏側的故事，宙、伽馬獸與夥伴們，將踏入數碼寶貝們不可思議的世界中。